冷却塔的水温一般在32-37℃之间，又有阳光，比较适合微生物藻类繁殖。藻类、细.菌和真.菌快速繁殖，会使冷却水颜色变黑，发生恶臭，污染环境，严重时会危及人体健康。同时，这些微生物分泌出大量粘液，将水中不溶性杂质粘接在一起，附着于管道和设备的内壁，阻碍水的流动和热交换，水头损失增加，多耗电能，造成高压运行。沉积在金属表面的粘泥还会引起垢下腐蚀。此外，冷却塔的配水槽和喷嘴上也常因藻类繁殖而堵塞孔口，影响配水的均匀性而使塔的冷却效率下降。 
    循环冷却系统内存在的细.菌也对人们身体健康造成极大的危害。据权威机构调查，约60%的冷却水中存有军团菌。它可以通过两个途径传播给人体，一是空调冷却塔的雾滴进入大气而转入人们呼吸道，另一种是供水系统携带病菌传输给人们。进行循环系统水质管理，定期杀.菌灭藻，杀灭细.菌微生物，可以保护人们身体健康，创造一个良好的工作、生活环境。
　　因此，微生物菌藻对空调循环水系统造成的危害——堵塞管道，阻碍水的循环，减少热交换效率，损害人们身体健康。